随着黄金72小时救援时间的结束，灾区的救援重点将从救人逐步转移到重建。但灾后还有很多问题需要防范，不能掉以轻心。一方面，频繁发生的余震和已经在部分地区出现的降雨极易导致次生灾害，另一方面，雨后湿润的环境易造成细菌滋生传播，再加上生活卫生设施毁坏严重、人畜尸体腐烂等原因，科学防疫工作迫在眉睫。同时，地震给人们带来的心理创伤也不能忽视，应及时进行心理干预。
防范次生灾害
山体滑坡与塌方
芦山县、宝兴县一带的地质地貌条件和汶川一样，很容易发生山体滑坡和塌方等地质灾害，而且目前已经发生了。中科院科技救灾专家组对芦山县太平镇、宝盛乡、龙门乡等三个乡镇的调查显示，三个乡镇共出现新滑坡、崩塌点1200余处。由地震引起的地面滑坡、崩塌现象较为突出，在余震影响下滚石、崩塌等险情会造成山区道路时常中断，给震后应急抢险造成困难。
泥石流
如果出现大的降水，则可能在滑坡或塌方的基础上出现泥石流，即大量雨水伴随着土石从山上泄下来。
堰塞湖
20日，地震致芦山县宝盛乡玉溪河一带形成一个堰塞湖。阻塞形成堰塞湖的土石方，土质很松软，很可能发生剧烈的垮塌，这样下游的居民就很危险。目前玉溪河堰塞湖已排空，险情解除。
水库溃坝
地震致雅安市5座水库的坝体出现裂缝，一旦发生水库溃坝，很多村镇会被水淹没。21日，5座出险小型水库已采取降低库水位、疏散下游群众等应急措施，险情得到控制。
防疫防病要点
确保食品安全
灾区群众要防止病从口入，勤洗手，喝开水，不吃生食、冷食和过夜的食物，对从废墟中“抢救”出的食物，切记煮熟煮透。
