不过，“环保署长”沈世宏说，“环保署”邀内政、财政等部会代表研商，认定温室气体“并非完全地方自治事项”。

他表示，温室气体排放并非直接影响当地，而是平均浓度升高导致暖化、气候变迁，因此“在高雄排放等同在台湾排放”，向企业收取温室气体排放费，必须由当局统一办理，地方收费的适法性有问题。

苏治芬表示，云林县政府计划征收的碳费，符合地方自治权限和污染者付费精神，与“行政法”中的空气污染防制法相似，“‘环保署’把碳费与碳税搞混了，应该重新思考。”

她表示，“财政部”不核定云林县提出征收“碳税”，另提“碳费”，“环保署”也不同意，云林县政府今年1月，已向大法官会议申请，希望大法官会议尽快解释，6月8日也将举办绿能与减碳论坛，收集各界对碳费的意见，希望当局重视。