九十年代
1990年7月11日，海部俊树首相在西方七国首脑会议上宣布将恢复对华政府贷款。
1990年8月27日，樱内义雄众议院议长访华。
1990年11月12日，吴学谦副总理以中国政府代表身份出席明仁天皇即位典礼。
1991年8月10日，海部俊树首相访华。这是“六。四”风波后访华的第一位西方国家现职政府首脑。
1992年4月6日，江泽民总书记访日，邀请日本明仁天皇和皇后访华。
1992年5月25日，万里委员长访日。
1992年10月23日，明仁天皇和皇后访华，这是历史上日本天皇首次访华，填补了中日关系史上的一项空白。
1993年11月19日，江泽民主席在出席西雅图APEC会议期间会见细川护熙首相。
1994年2月23日，朱镕基副总理访日。
1994年3月19日，细川护熙首相访华。两国政府签订环保合作协定。
1994年4月29日，原文兵卫参议院议长访华。
1994年8月27日，土井多贺子众议院议长访华，到天津抗日殉难烈士纪念馆凭吊抗战时在日死难的中国劳工。
1994年9月12日，日本政府不顾我强烈反对和严正交涉，允许台行政院副院长徐立德赴日出席广岛亚运会开幕式，引发中日广岛亚运会风波。
1994年10月28日，荣毅仁副主席访日。这是我国家副主席首次访日。
1994年12月22日，中日两国政府就日向我提供第四批政府贷款(前三年部分)达成协议。
1995年4月10日，乔石委员长访日。
1995年5月2日，村山富市首相访华，作为战后日现职首相首次参观了卢沟桥和中国人民抗战纪念馆。
1995年8月15日，村山首相在战后五十周年之际代表日本政府就历史问题发表谈话，明确表示愿正视历史，承认侵略，对此表示深刻反省和道歉。
1995年8月29日，日本政府抗议我核试验，宣布冻结对我无偿援助。
1995年11月18日，江泽民主席在出席大阪APEC会议期间会见村山富市首相。
1996年7月起，日本右翼团体成员连续四次登上钓鱼岛，引发中日钓鱼岛风波。
1996年7月29日，桥本龙太郎首相参拜靖国神社。
1996年11月24日，江泽民主席在出席马尼拉APEC会议期间会见桥本龙太郎首相。
1997年9月4日，桥本龙太郎首相访华，成为战后访问我东北地区的第一位日本现职首相，并参观了“九·一八”纪念馆。
1997年11月11日，李鹏总理访日，提出发展中日关系五原则“相互尊重，互不干涉内政；求同存异，妥善处理分歧；加强对话，增进了解；互惠互利，深化经济合作；面向未来，实现世代友好。同日，中日两国政府签署渔业协定。
1998年4月21日，胡锦涛副主席访日，强调发展中日关系要以史为鉴，面向未来。
1998年11月，江泽民主席对日本进行国事访问，双方发表《中日联合宣言》，宣布两国建立“致力于和平与发展的友好合作伙伴关系”。
1999年7月8日，小渊惠三首相正式访华。
1999年12月8日，中共中央政治局常委、全国政协主席李瑞环对日进行正式友好访问。
二十一世纪
2000年4月4日，中共中央政治局候补委员、中央书记处书记兼中组部部长曾庆红同志率中国共产党代表团对日本进行友好访问。
2000年5月10日，唐家璇外长正式访日。
2000年5月20日，江泽民主席会见5000多名日本各界组成的日中文化观光交流使节团，就发展民间友好发表重要讲话。
2000年5月29日，日本执政三党干事长访华。
2000年6月7日 钱其琛副总理作为中国政府特使赴日本出席日本政府为小渊惠三前首相举行的葬礼。
2000年8月28日，日本外务大臣河野洋平应邀对中国进行正式访问。
2000年10月12日，朱镕基总理正式访日。
2001年4月3日，日本文部科学省宣布通过右翼炮制的历史教科书，中方提出强烈抗议，要求日本政府纠正错误。
2001年4月20日，日本政府允许李登辉以治病为名赴日。中方提出严正交涉，采取冻结中日高层往来、军舰访日、安全对话等措施。
2001年7月9日，日本执政三党干事长访华。
2001年8月13日，日本首相小泉纯一郎参拜靖国神社。
2001年10月8日，日本首相小泉纯一郎对华进行工作访问，参观卢沟桥抗战纪念馆，对日本侵华历史表示反省和道歉。
2001年10月21日，江泽民主席会见出席上海APEC会议的日本首相小泉纯一郎。
2001年11月5日，中日韩三国领导人在文莱10+3会议期间举行会晤，朱钅容 基总理和日本首相小泉纯一郎出席。
2001年12月21日，中日双方就解决大葱、香菇、蔺草席三种农产品贸易争端达成共识，日方决定不启动正式保障措施，中方撤消特别关税报复措施。
2001年12月22日，日本海上保安厅巡视船追逐一艘不明国籍船只进入我专属经济区水域，双方发生交火，不明国籍船只沉没。中方对日本在东海海域使用武力表示不满。
2002年4月2日至9日，李鹏委员长对日本进行正式友好访问，并与日本首相小泉纯一郎共同出席纪念中日邦交正常化30周年“中国文化年”、“日本文化年”开幕式。
